Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Edn3P48299 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms