Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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VdrP48281 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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VdrP48281 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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