Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms