Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms