Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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