Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nedd1P33215 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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