Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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