Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms