Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Xrcc5P27641 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Xrcc5P27641 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Xrcc5P27641 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Xrcc5P27641 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Xrcc5P27641 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc5P27641 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms