Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NdnP25233 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms