Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PparaP23204 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PparaP23204 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PparaP23204 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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