Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms