Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18526 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18526 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18526 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18526 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18526 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18526 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms