Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms