Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DmdP11531 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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DmdP11531 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DmdP11531 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms