Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms