Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms