Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops6O88545 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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