Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms