Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms