Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms