Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms