Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm28048F7BCN0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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