Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms