Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sfta2E9PXB6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms