Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms