Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms