Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms