Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem235B1AQL3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms