Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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H2-M5A7VMS3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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