Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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