Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccl8Q9Z121 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms