Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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