Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms