Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms