Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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