Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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