Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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