Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gpa33Q9JKA5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gpa33Q9JKA5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms