Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms