Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn4aQ9ER60 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn4aQ9ER60 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn4aQ9ER60 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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