Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms