Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms