Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lonrf3Q9D4H7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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