Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lamp5Q9D387 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms