Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fndc8Q9D2H8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms