Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms