Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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