Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SdhdQ9CXV1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SdhdQ9CXV1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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SdhdQ9CXV1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SdhdQ9CXV1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SdhdQ9CXV1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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