Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prkrip1Q9CWV6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms